2.2.1种子精选。在播种前对待繁的自交系种子进行人工精选，根据该品种粒型、粒色等形态特征挑去杂粒、病粒和小瘪粒，留典型特征一致、籽粒饱满的种子作种用。
　　2.2.2苗期除杂、去劣。在幼苗长至3~5片叶时，结合间定苗，根据该品种叶鞘、叶缘、叶片颜色、叶片宽窄、叶片的长相等特征除去杂苗和小劣苗，保留典型特征一致健壮苗。
　　2.2.3中期除杂。在自交系进入拔节期，根据株型、株高、叶色叶脉等特征除杂，除去杂株、变异株。以此除杂一般进行2~3次，再抽雄除净。
　　2.2.4花期除杂。在自交系雄穗抽出后，根据该品种雄穗分枝的多少，颖壳、花药颜色株型、长势、花丝颜色等特征除去杂株和变异株。
　　2.2.5收获期除杂。在自交系收获、晾晒过程中，根据果穗性状、籽粒颜色等特征，除去杂穗。
　　2.3加强管理，防止机械混杂
　　在自交系的收获、运输、晾晒、脱粒、精选、包装、储贮过程中，要由专人负责，做好标识，防止人为弄错或混杂。
　　2.4实行自交、姊妹交隔年交替繁殖
　　第1年在原种圃内选择100~200株生长良好的典型优株套袋自交，收获穗选混合脱粒，供下年繁殖。第2年将上年套袋自交的种子在安全隔离区繁殖，再选100~200株典型优株套袋，然后进行成对姊妹互交。收获后严格穗选混合脱粒供下年繁种用。用这种方法既可保持自交系的良好种性，又可有效防止因连续自交所造成的退化。
　　2.5一次繁种，多年贮存使用
　　对生产上常用的自交系一次超量繁殖，将所产种子在低温库内冷藏，这样就减少了自交系的繁殖次数，也就减少了繁殖过程中生物学混杂和机械混杂，以及基因变异的机会，从而有效地保证自交系的纯度。
　　2.6提纯自交系
　　在自交系的繁殖过程中，由于多方面的因素，发生程度
　　不同的混杂退化现象难以避免，如不加以提纯，一些优良的自交系很快就会失去其使用价值。因此，自交系一旦发生混杂，必须立即通过提纯的方法重新生产自交系原种，尽可能恢复自交系的纯度和典型性，这样才能充分保证杂交种的杂种优势。
　　自交系的混杂退化有其不可避免的自然因素，也有可以避免的人为因素。为此，必须牢固树立“防杂重于去杂”、“保纯重于提纯”的意识，使自交系的繁殖工作始终处于完全主动的地位，以确保能为玉米杂交制种提供高纯度生活力的亲本。
　　
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