3．1设计思路公立医院的组织结构应以权力集中于中高层为特征，医院的医疗活动按照功能划分为若干个职能部门，如医护部、办公室、财务科等，每一个部门又是一个垂直管理系统，由医院最高层领导直接进行管理。医疗过程的主要决定，必须在高层主管和职能部门的同时介入才能作出。它的特点是：由于是垂直领导，有利于医院集中有限的资源，按总体设想，投资到最有效的项目上去，层次清晰而运行高效，医疗服务各个环节之间紧密协调。从而既满足现代医院管理层次性和系统性的自身需求，又符合市场化高效和精炼的外部要求。

　　3．2结构设计任何一个公立医院的组织结构都存在三个相互联系的问题，即管理层的划分、部门的设置、职权的确定，合理组织结构设计就是要正确处理这三个方面的问题。
　　3．2．1管理层的划分。根据管理幅度的限制，确定管理层次，并规定各层次管理人员的职责和权限。
　　一个医院中管理层的多少，应具体根据医院规模的大小、业务活动的特点以及管理制度而定，一般为上层、中层和基层。
　　上层。即医院的最高决策层或经营管理层，其主要任务是从投资者的角度及医院整体利益出发，对整个医院实行统一指挥和综合管理，并制定医院总目标及实现目标的一些大方针。决策层一般为医院所有者的权力机构，如医院董事会、医院管理委员会、卫生行政主管部门等，决策层不参与医院日常经营活动。经营管理层一般为医院经营管理者——院长层。在经营管理层这一级组织结构中，医院党组织书记由上一级党组织部门公开选聘，组织任命或指派；院长则实行职业院长聘任制，由医院董事会(理事会)、医院管理委员会、卫生行政主管部门聘任，董事会与聘任院长形成委托一代理关系。副院长应由院长聘任。
　　中层。即职能层，由院长任命或公开竞争选聘职能科主任，主要任务是负责分目标的制定，拟定和选择计划的实施方案、步骤和程序，按部门分配资源，协调下级的活动，上通下达，以及评价组织活动的成果和制订目标的措施等。
　　基层。即执行层，由职能科主任和业务科主任公开选聘科室员工，主要任务是按照规定的计划程序协调基层员工的管理工作，完成各项计划和任务。
　　3．2．2部门的设置。根据不同标准，将医院活动按服务流程，分解为不同的岗位和部门任务。公立医院可根据医院使命、目标和战略发展要求，将医院各职能部门重新组合为“五部一办”：
　　医疗护理部：由以贯彻现代质量管理(MQM)为主要职能的医务科、质控科、科教科、护理部合并而成，中心任务是行使全院涉及医疗质量的监督、检查、协调、沟通职能，统合医疗质量政策，在医护部主任领导下协调全院医护关系、医护流程、医护环节和医护质量的全程管理。是全院绩效管理中质量否决制实施的核心部门。
　　人力资源部：是医院人事政策与人力资源管理的核心部门，掌握和分析员工资讯，为全院战略发展提供员工招募培养计划。是全院绩效管理与薪酬管理的核心部门。
　　业务拓展部：负责市场开发、营销，医疗信息收集、分析和反馈等，一方面拓展病人来源，另一方面为医院的业务发展决策提供依据和信息支持。
　　后勤保障部：由设备科与总务科合并而成，专司为一线科室服务的保障之职。
　　财务核算部：在严格执行国家财务法规和财经纪律以确保财务安全的前提下，合理安排资金与预结算工作。同时，大力开展全成本核算，配合全院绩效管理制度的实施。
　　综合办公室：由党总支办公室、院办公室、信息科等合并而成，一是医院行政效率即执行力的监督部门，二是为一线科室管理及医院决策提供及时与真实可靠的信息，也是全院内部员工的服务部门。
　　3．2．3职权的确定。职权就是职务的管理权限，在医院内部，最基本的信息沟通是通过职权关系来实现的，通过职权关系上传下达，使下级按命令行事，上级及时得到反馈的信息，并进行有效的控制，做出合理的决策。职权的类型有三种：
　　直线职权：是直线人员所拥有的包括发布命令及执行决策系统的权力，即指挥权。院长有指挥部门及科主任的职权，部门及科主任有指挥本部门科室员工的直线职权。
　　参谋职权：包括提供咨询、建议等，医院内的任何一个主管人员既可以是直线人员，拥有直线职权，又有向上级提建议的参谋职权，每个普通员工也都拥有参谋职权。
　　职能职权：为改善和提高管理效率，主管人员将职权作些变动，根据自己的职权委托他人行使，如院长的职权一部分由副院长行使，部门科室主任的一些职权，一部分由副主任或职工行使。
　　3．2．4医院组织运行。设计出的医院组织结构仅仅是一个框架，处于静态之中，为了使组织结构在实现目标过程中充分发挥作用，必须使它转起来，由静变动。按照组织结构中的职位要求配备相应的人员，因岗选人，正确处理集权与分权，直线职权、参谋职权与职能职权，个人集权与集体管理的关系，并在其运转过程中不断实施指导及控制工作，同时进行组织分析，以使组织结构有序运转。