根据区域创新系统的系统本质属性，结合系统评价研究的特点，展望系统评价研究的发展趋势，我们认为在今后的评价研究中，可以按照系统论的思想构建区域创新系统的评价框架并对其进行综合评价。在系统论看来，整体和其若干要素都是实在的，各要素相互关联构成了整体即系统；任何一个系统都不可能完全封闭，都是在特定的环境中存在并发展的；开放的系统能够产生自组织过程，激励内部要素的非线性相互作用，通过竞争合作推进系统的演化。系统论的基本思想主要有两点，一是整体性，即每一系统都由要素、子系统按一定方式相互联系并显示出整体突现性，同时系统作为一个整体与外部环境之间也是相互联系和相互制约的；二是动态性，即系统的状态随时间不断发生变化的特性。系统在进化中，层次性、复杂性都在不断增加着，总体结构和功能也在递增着。

　　按照系统论的理念，对区域创新系统内涵可以有更进一步的认识：

　　第一，根据系统内的创新主体及系统功能，将区域创新系统划分为五大子系统，即产业网络子系统、知识创新子系统、技术创新子系统、技术服务子系统和制度创新子系统。这五大子系统只有系统协同、发展共同，才能使各自的功能得到最大程度的发挥，从而保持系统的整体稳定与发展。第二，区域创新系统根植于一定地域空间的政治、经济、社会、文化和生态环境中，系统中的区域具有全球性，系统内的要素单元与系统外部的企业、高校、科研机构等存在互动关系，带来知识、技术等资源的区际或国际流动，能促进区域经济和社会的发展。第三，区域创新系统是动态的系统，即系统的状态随时间不断发生变化。这种变化源于内部子系统之间、系统与外部经济区域间的相互作用。区域创新系统就是通过系统内各主体要素的相互联系、相互作用，并不断和系统外进行交流，实现系统向体系化、合理化方向发展并最终达到成熟状态。

　　依据上述指导思想，对区域创新系统可以分别从系统结构、系统对区域经济社会的贡献和系统的发展进程进行评价，即从区域创新子系统之间的协调性(Harmony)、创新能力的有效性(Efectiveness)和成熟度(Maturity)个方面构建评价模型，具体的模型分析与评价有待另文探讨和研究。